Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprdQ64487 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprdQ64487 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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