Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clcn1Q64347 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn1Q64347 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms