Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf4Q64287 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf4Q64287 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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