Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa17Q64016 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Defa17Q64016 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Defa17Q64016 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Defa17Q64016 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Defa17Q64016 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa17Q64016 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms