Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PatjQ63ZW7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PatjQ63ZW7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms