Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift52Q62559 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms