Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa13Q62424 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms