Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Taf6Q62311 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms