Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpaQ62189 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms