Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ttf1Q62187 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttf1Q62187 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms