Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx3xQ62167 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms