Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms