Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms