Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pabpc2Q62029 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms