Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde1aQ61481 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pde1aQ61481 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pde1aQ61481 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pde1aQ61481 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Pde1aQ61481 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde1aQ61481 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms