Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vsx2Q61412 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vsx2Q61412 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vsx2Q61412 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms