Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nab1Q61122 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nab1Q61122 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nab1Q61122 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nab1Q61122 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nab1Q61122 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nab1Q61122 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nab1Q61122 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms