Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms