Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
JrkQ60976 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms