Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms