Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samhd1Q60710 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samhd1Q60710 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms