Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ItgaeQ60677 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms