Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim38Q5SZ99 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms