Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc42Q5SV66 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms