Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms