Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps54Q5SPW0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms