Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc85aQ5SP85 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc85aQ5SP85 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms