Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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