Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms