Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Nlrc3Q5DU56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nlrc3Q5DU56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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