Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms