Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10488Q4KL05 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10488Q4KL05 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms