Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1nQ497L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms