Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa20Q45VN2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms