Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Snx25Q3ZT31 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms