Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap2Q3V1H1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms