Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc185Q3V118 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms