Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms