Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Dnah12Q3V0Q1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Dnah12Q3V0Q1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms