Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Lrrc43Q3V0L5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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