Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Garnl3Q3V0G7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Garnl3Q3V0G7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms