Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SvipQ3UZP4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms