Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms