Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mbd3l2Q3UXB0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms