Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E330034G19RikQ3UWX6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms