Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn4Q3UV66 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms