Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm29609Q3UU56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms