Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B230104I21RikQ3USW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms