Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
E130208F15RikQ3UPV3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms