Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms